Su propósito es dar a conocer los resultados de las investigaciones científicas originales e inéditas en las diferentes disciplinas de la Botánica, teniendo un especial interés en las plantas mexicanas. Su periodicidad es trimestral. El idioma en que se presenta es el español, aceptando también trabajos en inglés, francés y portugués. Está incluida en Agrícola, Biological Abstracts, BIOSIS Previews, Dialnet, Índice de Revistas Mexicanas de Investigación Científica y Tecnológica del CONACyT, Journal Citation Reports/Science Edition, Latindex - Catálogo (Sistema Regional de Información en Línea para Revistas Científicas de América Latina, el Caribe, España y Portugal), RedAlyC  (Red de Revistas Científicas de América Latina y el Caribe, España y Portugal), SciELO, Science Citation Index Expanded y Scopus.

A partir del año 2009 la revista Acta Botanica Mexicana cuenta con el cálculo de factor de impacto en el Journal Citation Reports, del ISI Web of Knowledge. Para el año 2012 es de 0.305.

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